Resistir el cambio climático: una beca para investigar los pistachos
Los científicos ganan la subvención HiFi for All SMRT 2020 para secuenciar el ADN y el ARN de los pistachos
La empresa de biotecnología PacBio financia un proyecto de investigación en colaboración que hará avanzar significativamente el conocimiento sobre la construcción genética de los pistachos. Científicos del IVICAM-IRIAF de España, del Consejo de Investigación y Economía Agraria de Italia, de la Universidad de Palermo, del Instituto Max Planck de biología del Desarrollo y de la Universidad de California en Davis trabajarán juntos para sentar las bases que permitan a los pistachos ser más resistentes al cambio climático.
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Esaú Martínez
Los pistachos son muy nutritivos y pueden resistir períodos de sequía y clima cálido. De hecho, se utilizan para sustituir otros cultivos en regiones afectadas por el calentamiento global y los cambios en los patrones de precipitación. Pero incluso los pistachos se ven afectados por el cambio climático: Normalmente, el árbol empieza a florecer cuando ha experimentado temperaturas frías durante cierto tiempo. Con inviernos cada vez más cálidos, este mecanismo de sincronización incorporado se interrumpe, y la cosecha en las principales zonas productoras, como Irán, California, España e Italia, puede disminuir o incluso ser nula en algunas temporadas. "Los productores de pistacho ya están empezando a experimentar los efectos negativos del cambio climático", advierte Esaú Martínez, del CIAG-IRIAF de España. Es probable que estos efectos se hagan más notables en el futuro.
Algunos cultivares de pistacho se adaptan mejor al calor que otros
Curiosamente, la resistencia al cambio climático varía entre los distintos cultivares. Por ello, el equipo de investigadores se propone identificar las variantes genéticas que permiten la adaptabilidad. "Buscaremos la variación del genoma en seis cultivares de pistacho que difieren en el requisito de frío de la inducción de la floración, el tamaño del fruto y el sexo", explica Pablo Carbonell-Bejerano, del Instituto Max Planck de Biología del Desarrollo de Tubinga. Estos cultivares son altamente heterocigotos, lo que significa que para muchos de sus genes albergan copias contrastadas en el conjunto de cromosomas heredados de cada uno de sus dos progenitores. Lo que los hace aún más interesantes para la cría es su alta diversidad de haplotipos: es probable que se encuentren muchas variantes de un conjunto cromosómico en la población.
Un avance significativo en la comprensión del genoma del pistacho
Los investigadores obtuvieron la secuenciación de alta fidelidad (HiFi) de PacBio para diez células de molécula única en tiempo real (SMRT). Eso permitirá determinar con gran precisión la secuencia de nucleótidos en el ADN de todo el genoma de los cultivares de pistacho. Tras recoger las muestras en España esta primavera, el material se procesará en las instalaciones de Gentyane en Auvernia. Los investigadores también secuenciarán el ARN transcrito en diferentes órganos de cada cultivar para determinar dónde se ubican los genes codificantes en sus genomas, así como para identificar la variación en las formas de transcripción expresadas entre los cultivares. "Esta es una gran oportunidad para avanzar en los recursos genómicos para ayudar a la mejora del pistacho", subraya Carbonell-Bejerano. Los investigadores esperan comprender mejor el origen de la diversidad en rasgos agronómicos relevantes. Sus hallazgos ayudarán a identificar qué variantes hacen que los pistachos sean más resistentes a los retos del cambio climático y podrían proporcionar una base para la adaptación al clima mediante la mejora genética.
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