In einigen raffinierten, also gereinigten und verarbeiteten, Pflanzenölen und -fetten, sind 2-MCPD-Fettsäureester zu finden. Lebensmittel, für deren Herstellung raffinierte Pflanzenfette verwendet werden, können deshalb 2-MCPD-Fettsäureester enthalten. 2-MPCD und verwandte Stoffe wurden z. B. in Margarine, Back- und Konditoreiwaren, frittierten Produkten, verschiedenen Snack-Produkten sowie Säuglingsanfangs- und Folgenahrung nachgewiesen.
Diese Stoffe kommen in der Natur nicht vor. Für 2-MCPD-Ester lassen sich laut dem Bundesinstitut für Risikobewertung noch keine sicheren Aussagen über mögliche gesundheitsschädliche Auswirkungen machen. Chemisch eng verwandte Stoffe (3-MCPD-Fettsäureester) lösten im Tierversuch in größeren Mengen jedoch pathologische Veränderungen in den Nieren und andernorts aus.