Vegetative Merkmale
Der Garten-Rettich ist eine ein- bis zweijährige krautige Pflanze, die Wuchshöhen von 30 bis 100 Zentimetern erreicht. Der Garten-Rettich bildet Hypokotylknollen oder Wurzel-Hypokotylknollen, das heißt an der Bildung der Knolle ist nur das Hypokotyl oder Hypokotyl und Wurzel beteiligt. Die Farbe und Größe der Knollen ist dabei sehr variabel. Der Stängel ist ästig, röhrig, kahl oder mit breuten derben Borsten besetzt. Er ist oft violett, besonders in den Achseln der Seitenzweige. Die Laubblätter sind gezähnt, fiederspaltig oder gefiedert, jedoch sind die Fiedern nicht bis zur Rhachis getrennt. Die Stängelblätter sind nicht stängelumfassend. Die unteren Blätter sind leierförmig fiederschnittig mit einem großen geschweift-gekerbten Endabschnitt. Sie Seitenlappen sind kleiner, länglich-eiförmig, gezähnt und zerstreut mit angedrückten Borsten besetzt.
Generative Merkmale
Die Blütezeit liegt im Mai und Juni. Die Blütentrauben sind locker und umfassen durchschnittlich 30 Blüten. Die Blütenstiele sind 1 bis 2 Zentimeter lang und zerstreut borstig. Die zwittrigen Blüten sind vierzählig. Die Kelchblätter sind 6,5 bis 10 Millimeter lang, länglich und kahl oder zerstreut borstig. Die vier Kronblätter sind weiß oder violett, dabei sind die Adern dunkler. Im Umriss sind sie verkehrt eiförmig und 17 bis 22 Millimeter lang. Sie sind lang genagelt und vorn schwach ausgerandet. Die Antheren sind gelb. Der Fruchtknoten ist grün oder rot; sein unteres Glied ist 0,5 Millimeter lang, das obere Glied enthält 8 bis 18 Samenanlagen. Der Griffel ist 4 Millimeter lang. Die kurze, gedunsene Schote ist nicht oder nur leicht perlschnurartig gegliedert. Bei Reife bleibt die Frucht geschlossen. Die reifen Früchte stehen auf aufrecht-abstehenden Stielen, sind zylindrisch und oben kegelförmig zugespitzt. Ihr unteres Glied ist 1 bis 3 Millimeter lang, verkehrt kegelförmig und meist samenlos. Das obere Glied ist 3 bis 9 Zentimeter lang, 0,8 bis 1,4 Zentimeter breit, innen schwammig, außen strohig und blass. Die Samen sind eiförmig, 4 Millimeter lang, 3 Millimeter breit, netzig-grubig, hellbraun und haben einen schwarzen Nabelfleck.
Die Chromosomengrundzahl beträgt x = 9; es liegt meist Diploidie vor mit einer Chromosomenzahl 2n = 18, selten 36.