Hexanal wird in der Natur gebildet, wenn ungesättigte Fettsäuren durch Oxidation abgebaut werden. Es kommt unter anderem in Äpfeln, Erdbeeren, Aralia (Aralia cordata), Weißkohl, Spanischem Pfeffer, Capsicum frutescens, Wasserminze, Petersilie, Kartoffeln, Süßkraut (Stevia rebaudiana), Telosma cordata sowie in Orangen- und Zitronenöl vor.
Der Aldehyd ist geruchlich wahrnehmbar, wenn zum Beispiel der Rasen geschnitten oder eine Apfelmaische hergestellt wird. Erst mit der Zeit wird das Hexanal reduziert zum geruchlosen Hexanol. In Apfelsaft, Orangensaft oder Olivenöl ist es durchaus in kleinen Mengen erwünscht.
