Beispiele von Lebensmitteln, bei deren Herstellung Mikroorganismen genutzt werden:
- Milchprodukte wie Joghurt und ähnliche Sauermilchprodukte, saure Sahne, Käse (Milchsäurebakterien, Kefirhefen, Propionibacterium, Brevibacterium linens (Rotschmierebakterium), Penicillium camemberti (Weißschimmel), Penicillium roqueforti (Blau- oder Edelschimmel) und viele mehr)
- Sauerkraut, Salzgurken und andere Sauergemüse (Milchsäurebakterien)
- Essig (Essigsäurebakterien: Acetobacter, Gluconacetobacter)
- Alkoholische Getränke wie Bier (Bierhefe Saccharomyces cerevisiae), Wein (Weinhefe), Pulque (das Bakterium Zymomonas mobilis), Sake (Aspergillus oryzae, Sake-Hefen)
- Weißgebäck (Backhefe Saccharomyces cerevisiae)
- Sauerteigbrot (Milchsäurebakterien und Hefen)
- Pökelfleisch (Nitrat-reduzierende Kokken, Milchsäurebakterien, Enterococcus faecium, Vibrio-Arten, halotolerante Hefen)
- Rohwürste (Milchsäurebakterien, nitratreduzierende Kokken (z. B. Staphylococcus carnosus, Streptomyces griseus), Penicillium nalgiovense)