Des échantillons de lait datant des années 1940 jettent un nouvel éclairage sur la résistance aux antibiotiques
Dans les années 1940, quelqu'un de l'actuel département de pathobiologie et de sciences vétérinaires s'est procuré un lyophilisateur, un équipement qui lyophilise les échantillons, explique le Dr Guillermo Risatti, directeur du Connecticut Veterinary Medical Diagnostic Laboratory (CVMDL). Guillermo Risatti. Il explique qu'à l'époque, le laboratoire de microbiologie était très actif dans l'analyse du lait pour les fermes laitières de la région. Grâce à un nouvel équipement très intéressant, il semble qu'ils aient commencé à lyophiliser des centaines d'échantillons.
Exposition agricole à l'université de Californie en 1945, à l'époque où les échantillons de produits laitiers ont été prélevés.
Department of Archives & Special Collections/UConn Library
Les échantillons sont stockés depuis lors. Outre le fait qu'il s'agit d'échantillons de lait contenant des bactéries Streptococcus datant des années 1940, Risatti explique que lui et ses collègues - Zeinab Helal, associée de recherche au CVMDL, Ji-Yeon Hyeon (actuellement au College of Veterinary Medicine, Konkuk University, Séoul, République de Corée) et Dong-Hun Lee (également au College of Veterinary Medicine, Konkuk University, Séoul, République de Corée) - étaient intéressés par l'exploration de leur histoire microbienne.
Risatti explique qu'au fil des ans, les données ont été perdues et que les chercheurs ne disposent donc pas de détails précis sur la provenance des échantillons. Mais en connaissant un peu l'histoire du département, ils peuvent en déduire certaines informations.
"Nous pensons que la plupart d'entre eux proviennent du Connecticut ou peut-être de cas de la région, mais nous ne pouvons pas dire de quelles parties", explique M. Risatti. "Il est très probable que ce laboratoire offrait un service d'analyse aux habitants de la région, car il s'agissait principalement d'un laboratoire de pathologie. Aujourd'hui, il s'agit plutôt d'un laboratoire de diagnostic, et nous recevons des échantillons de toute la région, y compris de New York et du New Jersey."
La découverte de ces échantillons historiques pourrait aider la recherche de manière inattendue, mais la première étape consiste à reconstituer les détails perdus. Pour ce faire, Risatti explique que l'équipe a établi un flux de travail utilisant des techniques standard pour rationaliser les processus d'analyse des caractéristiques visuelles, appelées phénotype, et pour analyser leur génotype à l'aide du séquençage génomique.
Les différentes espèces de streptocoques utilisent des stratégies différentes pour infliger des maladies aux organismes qu'elles infectent. Ces facteurs de virulence sont utilisés pour différencier une espèce de Streptococcus d'une autre et constituent un moyen de distinguer les échantillons par l'analyse phénotypique. Une autre analyse phénotypique consiste à tester la sensibilité des bactéries aux antibiotiques.
Les chercheurs sont partis de 50 échantillons prélevés entre 1941 et 1947 et ont découvert qu'ils contenaient sept espèces différentes de Streptococcus , dont deux sous-espèces de S. dysgalactiae . Fait intéressant, les chercheurs ont constaté que certains des échantillons étaient résistants à l'antibiotique tétracycline et ne portaient pas les gènes de résistance aux antibiotiques que l'on trouve habituellement dans les souches bactériennes résistantes aux antibiotiques d'aujourd'hui. Ces échantillons ayant été prélevés avant l'ère des antibiotiques, les résultats s'ajoutent à une littérature de plus en plus abondante montrant que la résistance aux antibiotiques est apparue naturellement avant que l'homme ne découvre et ne commence à utiliser les antibiotiques.
"La résistance aux antibiotiques est un domaine de recherche très important, et ce depuis de nombreuses années", déclare Risatti. "Nous ne sommes pas allés plus loin dans notre analyse parce que nous ne disposons pas des outils nécessaires, mais nous espérons mettre ces informations à la disposition du public. Je pense que cela pourrait inciter quelqu'un à approfondir ses recherches".
M. Risatti explique qu'il espère établir des partenariats avec de grandes agences telles que le CDC et le ministère de la santé publique afin de soutenir la recherche sur la résistance aux antibiotiques.
Lors de l'élaboration du flux de travail, Risatti a également salué le travail des étudiantes Jillian Baron '24 (CAHNR) et Patricia Arceta '24 (CAHNR) :
"Il s'agit d'une bonne plateforme pour les étudiants de premier cycle, qui peuvent ainsi acquérir de l'expérience et publier leurs résultats. Je suis surprise par l'enthousiasme de ces jeunes gens. Je suis heureuse que nous puissions leur offrir l'espace nécessaire pour faire ce genre de choses.
Tourné vers l'avenir, Risatti est enthousiaste à l'idée de collaborations potentielles : "J'espère que les gens verront un lien entre ce que nous faisons au CVMDL et la santé humaine.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
Publication originale
Ji-Yeon Hyeon, Junwon Kim, David H. Chung, Zeinab H. Helal, Robert Polkowski, Dong-Hun Lee, Guillermo R. Risatti; "Genome analysis of Streptococcus spp. isolates from animals in pre-antibiotic era with respect to antibiotic susceptibility and virulence gene profiles"; Veterinary Research, Volume 55, 2024-4-15
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