Découverte d'une variété de tomate perdue : Les scientifiques découvrent la clé des tomates délicieuses
Le laboratoire de tomates du professeur Yuyang Zhang de l'université agricole de Huazhong révèle la variation génétique de la teneur en solides solubles dans la tomate.
Dans cette étude, les auteurs ont réalisé une étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) pour la CSP des fruits rouges dans une population composée de 481 accessions de tomates avec de grandes variations naturelles et ont trouvé un nouveau locus de trait quantitatif, STP1, codant pour une protéine de transport de sucre. La variation causale de STP1, une InDel de 21 pb, située dans la région du promoteur à 1 124 pb en amont du codon de départ, modifie son expression. Les accessions STP1Insertion avec une insertion de 21 pb ont un SSC plus élevé que les accessions STP1Deletion avec une délétion de 21 pb. L'inactivation de STP1 dans le TS-23 avec une CSP élevée à l'aide de CRISPR/Cas9 a fortement diminué la CSP dans les fruits. Des essais in vivo et in vitro ont démontré que ZAT10-LIKE, un facteur de transcription de la protéine à doigt de zinc (ZFP TF), peut se lier spécifiquement au promoteur de STP1Insertion pour renforcer l'expression de STP1, mais pas au promoteur de STP1Deletion, ce qui entraîne une diminution de la CSP des fruits dans les tomates modernes. L'analyse de la diversité a révélé que STP1 a été sélectionné lors de l'amélioration de la tomate.
Fig. 1 Analyse d'association à l'échelle du génome (GWAS) de la teneur en solides solubles (SSC) dans les fruits de tomate.
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Les auteurs ont identifié une variation causale naturelle à l'origine de la CSP chez la tomate et un nouveau rôle pour les TF ZFP dans la régulation des transporteurs de sucre. Les résultats enrichissent la compréhension de l'évolution et de la domestication de la tomate et fournissent une base génétique pour la sélection de tomates savoureuses.
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