des scientifiques de l'Université d'Ottawa s'associent à des partenaires mondiaux pour assurer l'avenir de votre café
Vous aimez siroter une tasse de café et profiter de son délicieux parfum ? Cette boisson populaire, appréciée dans le monde entier, trouve son origine dans l'humble plante de café, plus précisément l'espèce Coffea arabica. Comment cette plante a-t-elle évolué pour devenir la boisson que nous connaissons tous aujourd'hui ? Et quelles mesures pouvons-nous prendre pour assurer son avenir ?
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Coffea arabica est une espèce de café largement cultivée dont l'histoire évolutive est complexe. Des scientifiques de l'Université d'Ottawa ont participé à une étude récente qui a examiné ses variations génomiques. L'étude a permis de découvrir d'importants gènes associés à la résistance aux agents pathogènes, fournissant ainsi des informations précieuses sur les possibilités de sélection et les mécanismes de diversification.
Une équipe internationale de 70 chercheurs provenant de 15 laboratoires différents, dont le laboratoire de bioinformatique de l'Université d'Ottawa, a collaboré à ce projet. David Sankoff, professeur titulaire au Département de mathématiques et de statistique de la Faculté des sciences, a travaillé avec le candidat au doctorat Zhe Yu, dont la thèse de doctorat est liée à cette étude. De même, Daniella Santos Muñoz a effectué des recherches dans le cadre de son mémoire de maîtrise en rapport avec le projet. Parmi les autres contributeurs figurent l'ancien doctorant Chunfang Zheng et le professeur invité João Meidanis du Brésil.
La production de café, en particulier de Coffea arabica, réputé pour sa qualité et son goût exceptionnels, joue un rôle important dans l'économie mondiale. La recherche sur l'histoire génomique et évolutive de cette espèce est essentielle pour améliorer les pratiques de sélection et assurer la durabilité de la culture du café.
M. Sankoff souligne "l'étude détaillée de l'évolution, de la génétique, de la géographie et de l'histoire du génome du café Arabica. Les recherches menées dans notre propre laboratoire ont permis d'étudier ses liens avec différentes espèces de café, en particulier ses débuts en tant qu'hybride avec deux sous-génomes distincts, et la manière dont il réagit aux obstacles environnementaux, en examinant les changements dans les sous-génomes".
La génomique pour des cultures de café résistantes aux maladies
L'étude a permis de découvrir des groupes de gènes complexes chez Coffea arabica, mettant en évidence les zones génomiques associées à la résistance aux maladies, ce qui laisse entrevoir des méthodes potentielles pour améliorer la résistance des plants de café.
"La recherche sur le terrain a été principalement menée par des équipes en France et au Brésil. Les expériences en laboratoire ont eu lieu dans le laboratoire de Nestlé en Suisse, tandis que les données brutes ont été gérées à l'université de Cornell aux États-Unis. L'analyse a été réalisée par des chercheurs des États-Unis, de Finlande, de Singapour, de France, de Belgique, d'Italie et d'autres pays, y compris notre propre laboratoire. Le processus de rédaction a été principalement coordonné par le professeur Jarkko Salojärvi à Singapour et en Finlande", explique M. Sankoff.
La variété des plants de café disponibles aujourd'hui souligne l'importance de la diversité génétique dans la sélection du café. Cette diversité permet de développer des plants de café de qualité supérieure, plus savoureux, plus productifs et plus respectueux de l'environnement.
L'analyse génomique de l'étude met en lumière la trajectoire évolutive et le potentiel génétique de Coffea arabica, offrant ainsi des ressources pour la sélection du café. L'exploitation de la puissance de la génomique permettra de réaliser le potentiel de cette culture de boisson bien-aimée et d'assurer son succès continu face à l'évolution rapide des défis agricoles que représentent les agents pathogènes et le réchauffement climatique.
Note: Cet article a été traduit à l'aide d'un système informatique sans intervention humaine. LUMITOS propose ces traductions automatiques pour présenter un plus large éventail d'actualités. Comme cet article a été traduit avec traduction automatique, il est possible qu'il contienne des erreurs de vocabulaire, de syntaxe ou de grammaire. L'article original dans Anglais peut être trouvé ici.
Publication originale
Jarkko Salojärvi, Aditi Rambani, Zhe Yu, Romain Guyot, Susan Strickler, Maud Lepelley, Cui Wang, Sitaram Rajaraman, Pasi Rastas, Chunfang Zheng, Daniella Santos Muñoz, João Meidanis, Alexandre Rossi Paschoal, Yves Bawin, Trevor J. Krabbenhoft, Zhen Qin Wang, Steven J. Fleck, Rudy Aussel, Laurence Bellanger, Aline Charpagne, Coralie Fournier, Mohamed Kassam, Gregory Lefebvre, Sylviane Métairon, Déborah Moine, Michel Rigoreau, Jens Stolte, Perla Hamon, et al
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